“源代码既然可以随便用了，那开源软件还有版权可言么？” 这是很多普通人会对开源软件产生的合理疑问。不过，在看了前文的开源软件定义中对于源代码/原作者的保护条款之后，想必大家心里都已经有数了：即使是开源软件，原作者依然拥有代码的版权，这一点和软件是否开源、是否收费，其实是没有必然联系的。
更进一步地说，“版权”其实是一种对作者劳动的保护和肯定，它和专利不同，不需要申请或者注册，而是当某项作品完成时就自然产生了。这点对于开源软件也是一样的：很多开源软件在开放源代码的时候，也同样会注明源代码作者的名字——如果其他人修改代码，发布了他们自己的版本，那就要同时注明源代码作者和修改者的名字，以示对源代码的尊重。
而对于软件的使用者来说，不管他们是否为某一款软件付费，使用者所获得的都只不过是软件的“使用权”，即便某些开源软件（比如说下面会谈到的“自由软件”）允许用户任意修改代码和增删功能，那也是因为“作者允许你那样做”，而并非因为它“开源”。
在这方面，最常见的典型例子，其实就是Android（安卓）系统了——不错，无论是手机厂商还是个人ROM作者，都可以对安卓进行各种修改、深度定制，甚至是做成各种所谓的“xxUI”、所谓的“xxOS”。但是，安卓本身作为一个开源操作系统，其版权始终属于原作者谷歌，并不会因为手机厂商对其进行了定制、加上了其他代码而变更版权所有者。而这也是为什么所有的安卓手机在开机的时候都必需显示“Powered by android（基于安卓）”，在系统信息里都必须写明安卓版本号的原因。
此外，“开源软件就该免费”这也是很多人长期持有的错误观点。但实际上，根据“开源软件不得限制商业使用”的基本原则，开源软件其实是完全被允许收费的。这是因为在传播软件的同时进行收费是一项最基本的自由，每一个人都有这个自由。之所以我们很少看到付费的开源软件，并非因为开源软件不许收费，而是单纯因为这样做的人很少，所以大家“习惯了”免费的开源软件罢了。
在知名的开源软件许可协议GNU（通用公共授权）中，明确写着：“我们鼓励人们在向他人传播自由软件的同时收取费用，他们能收多少钱是他们的自由。如果一个软件许可不允许用户复制软件以向他人销售，那么这个许可就不是一个自由的软件许可。”
